Het BAU-team reist naar Idaho waar drie jonge vrouwen worden vermist. De dader is een informaticaspecialist die het internet en sociale netwerksites gebruikt om zijn slachtoffers te vinden.

Het BAU-team probeert in Los Angeles seriemoordenaar Billy Flynn in de kraag te vatten. Welke gebruik maakt van stroomstoringen, om in het donker bij zijn slachtoffers in te breken en hen te vermoorden.

Terwijl de Prins der Duisternis zijn moorddadige rooftocht door Californië voortzet, gaat de BAU achter hem aan om Detective Spicer's dochter van hem te redden.

Terwijl ze proberen twee verdachten te laten onthullen wat ze met een vermiste vrouw hebben gedaan, zet de BAU zich schrap voor het verlies van een van hun eigen mensen.

Gibbs en het team willen de naam zuiveren van een gepensioneerde marineofficier, nadat er cyanide is gevonden in een van de pakjes die hij stuurde naar actieve mariniers.

Gibbs en Ducky zien een antiek wapen op televisie en het is misschien het moordwapen in een zestien jaar oude zaak.

Het hoofdkwartier van NCIS wordt ontruimd, nadat het team materiaal om een bom te maken op het dak ontdekt. Ondertussen leest het team de eerste proef van Ducky's boek.

Gibbs krijgt de voogdij over een tienjarig vluchtelingen weesmeisje, wanneer uit een onderzoek blijkt dat ze het doelwit is van een gewelddadige bende.

Een van moord verdachte officier ontsnapt, wanneer de sheriff die hem vervoert, verongelukt in een meer. Torres werkt nauw samen met een blinde getuige die belangrijk bewijs hoorde dat nodig is om de zaak op te lossen.

Sara Carter smeekt Gibbs om de dood van haar moeder te onderzoeken. Ze denkt dat de verkeerde man is veroordeeld. Abby mag met iemand naar een vijfsterrenrestaurant. Ze moet wel beslissen wie ze meeneemt.

Een lid van het NCIS-team blijkt het volgende doelwit te zijn van een huurmoordenaar. Het team moet daarom door hun oude zaken spitten om erachter te komen wie wraak op hen wil nemen.

Gibbs woont een herdenkingsdienst bij voor een vriend die vermist was op zee. Hij ontdekt dat de man nog leeft, dat zijn boot werd aangevallen waarna hij naar de kust zwom en zich verborgen houdt in een schuilplaats.

Sloane weet vrijwel zeker dat de man die haar gijzelde en haar jaren geleden martelde in Afghanistan in leven is en in D.C. is. Vance en Gibbs vrezen dat ze alles zal doen om deze man te vernietigen.

Een maand nadat directeur Vance werd ontvoerd, krijgt Gibbs de rol van waarnemend directeur. Het team blijft ondertussen zoeken naar Vance.

Nadat een marineluitenant vermoord is gevonden in zijn bad, interviewt het team verschillende families in de eigenaardige buurt van het slachtoffer. Ook moet Torres de gevolgen onder ogen zien na een avondje uit met Palmer.

Het team onderzoekt een explosie buiten het huis van onderofficier Todd Nicholas en zijn vrouw, de populaire tv-ster Sheba Nicholas.

Gibbs rustige vakantie in zijn afgelegen hut wordt onderbroken door een verrassingsbezoek van Tobias Fornell en marine-kapitein Phillip Brooks. Ze moeten een overvaller vinden die zich ergens in het woud heeft verstopt.

Het team neemt het op voor een marinier die waarschijnlijk ten onrechte is veroordeeld, wanneer het team een vijftig jaar oude tape van een oud slachtoffer vindt.

Florence bereikt een nationaal publiek met haar ochtendshow op de radio. Ze zet zich in voor vrouwenrechten en tegen huiselijk geweld. Maar haar zorgeloze leventje

Florence kan haar geluk niet op, wanneer blijkt dat de belofte van 'Reset Inc.' waarheid is geworden. Ze reisde terug in de tijd en staat oog in oog met haar nog levende tienerdochter, Louise.